国内遠方での仕事を請け負い、代表取締役が1泊で出張に出向くことになりました。この出張では、交通費、宿泊費、食費の費用がかかることが予想されます。交通費、宿泊費、食費がすべて妥当な金額だとして、全部を実費精算した方がよいのでしょうか？

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出張時の諸経費ですが、実費で精算する場合交通費、宿泊費は大丈夫ですが、食事（1人で食べる通常の食事）は経費になりません。（どこに居ても食べるものであるため。）

出張旅費規程を設けて宿泊費の基準額や日当を定めていればすべて経費になりますので出張が多い場合には規定にしておいて方が処理も簡単ですし（定額のため）お得です。

ただし、金額が世間一般的な金額からみて高額と見られた場合には否認を受けますので金額設定にはご注意ください。