また、クレジットカードで購入すると、多くの場合納品書のみが同封されていて領収書はありませんが、納品書を領収書代わりに保存しておけばいいのでしょうか？

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他にも事業用の口座以外の口座から支出した経費があれば、事業主借勘定（事業主個人からの入金・資金提供の際に使う勘定科目） で経理します。

●領収書について
基本的に納品書は領収書の代わりにはできません。
通販などのインターネットでの購入の場合は、注文画面をアウトプットして、それと納品書とを合わせて保存しておいてください。