会社設立、事務所設置などの費用を、土地売却税から差し引く方法は有りますでしょうか？

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売却される土地の所有が、個人所有のものなのかそれとも会社所有のものなのかで取り扱いが異なります。

◆会社所有の土地の場合

会社の税金計算は1事業年度中の会社すべての収益・費用を差し引いた利益（所得）に対して課税されるため、当然、土地売却に係る利益とその他の事務所設置に係る経費などは、結局トータルで通算されることになります。

◆個人所有の土地の場合

個人所得と法人所得の計算は完全に別個に計算されるため、土地売却に係る利益と事務所設置に係る費用とを通算する術はありません。あくまでも土地売却に直接的に係る費用のみが、売却益から差し引かれます。

なお、土地売却に係る個人の所得税について、「居住用の不動産」ならば各種の優遇税制がありますので、もし該当するのならば注意が必要です。