キャッシュフロー上の問題で、短期的に運転資金が不足するため、社長個人から借り入れという形で解決したいと考えておりますが、そうした対応をした際に、経理上の証憑としては、借り入れ時、返済時、それぞれどのようなものを用意すればよいのでしょうか？

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社長個人から会社への貸付はよくある話です。契約書を作っても良いのですが、印紙代がかかるため、多くの会社は作成していません。通帳に個人通帳から振込で入金しておけば誰からの入金なのかが記録されますので、その程度で良いかと思います。

返済時にも振込が良いかと思います。利息についてもゼロにしておくことが多いかと思います。税務上も、会社に対する利益供与であれば、特に課税してくることはありません。ただし、逆に役員個人に対し会社のお金を貸し付ける場合は利息を必ず付けなければいけません。