帳簿をＰＣのエクセルでつけ、プリントアウトしたものを青色申告で提出することを考えているのですが、このような状態の帳簿は認められますでしょうか？

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青色申告では「複式簿記による記帳」が求められます。手書き帳簿でも、エクセルなどを使っても、あるいは市販の会計ソフトを使用しても、「複式簿記による記帳」ができていれば、方法は問われません。

複式簿記を行うために必要なのは、伝票または仕訳帳にて仕訳を行い、総勘定元帳へ転記する。そして集計である月次試算表を作成する。決算時には貸借対照表と損益計算書を作成し、決算報告とすることができておれば結構です。現金出納帳や売掛帳、手形帳などは、補助簿といい、総勘定元帳を補完する目的の帳簿ですので、必要に応じて記帳してください。

なお、決算や申告時に、帳簿を税務署へ提出することはありません。会社での保存義務があり、税務調査などで、帳簿の提示を求められた時、すぐ対応できるようにしておけば結構です。

請求書や領収書も一緒に保存してください。提示が求められたとき、これらの準備できなければ、取引を否認されることもあります。