会社設立費用（事務手数料）は資本金の中から捻出するものなのでしょうか？

例えば資本金100万円で会社を起こす場合には事務手数料＋資本金（100万円）を用意しておくべきなのでしょうか？宜しくお願いいたします。

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設立費用は資本金とは別に用意しておく必要があります。ただし、後日会社の口座ができたら、立て替えたものとして返してもらうことができます。

例えば、設立時に発起人の方から３５万円をお預かりします。その後、発起人の個人口座に資本金１００万円を振り込んでいただきます。よって、この時点で１３５万円必要です。後日会社ができあがって、資本金の１００万円が口座に入金された後は、発起人が立て替えた３５万円はその中から返してもらえることになります。

また、あまり事例はありませんが、発起人が設立費用を自腹で負担するのは自由です。